Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnk1eQ9JMK2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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