Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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Col5a3Q9JLI2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Col5a3Q9JLI2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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