Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nectin3Q9JLB9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms