Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg3Q9JL95 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prg3Q9JL95 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms