Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hmgn5Q9JL35 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hmgn5Q9JL35 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hmgn5Q9JL35 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn5Q9JL35 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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