Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gfra4Q9JJT2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms