Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms