Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms