Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Erg28Q9ERY9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms