Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms