Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SgshQ9EQ08 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SgshQ9EQ08 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgshQ9EQ08 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgshQ9EQ08 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgshQ9EQ08 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgshQ9EQ08 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgshQ9EQ08 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgshQ9EQ08 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgshQ9EQ08 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgshQ9EQ08 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgshQ9EQ08 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgshQ9EQ08 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms