Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TnmdQ9EP64 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TnmdQ9EP64 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms