Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Bap18Q9DCT6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Bap18Q9DCT6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Bap18Q9DCT6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Bap18Q9DCT6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Bap18Q9DCT6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Bap18Q9DCT6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Bap18Q9DCT6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Bap18Q9DCT6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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