Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Tspan4Q9DCK3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tspan4Q9DCK3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms