Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufa8Q9DCJ5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms