Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syde1Q9DBZ9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms