Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smdt1Q9DB10 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms