Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnpy3Q9DAU1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnpy3Q9DAU1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnpy3Q9DAU1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnpy3Q9DAU1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnpy3Q9DAU1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnpy3Q9DAU1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnpy3Q9DAU1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnpy3Q9DAU1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnpy3Q9DAU1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnpy3Q9DAU1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnpy3Q9DAU1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnpy3Q9DAU1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms