Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms