Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Alkbh4Q9D8F1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms