Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cyp2c55Q9D816 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms