Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn22Q9D7U6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn22Q9D7U6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn22Q9D7U6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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