Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

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Length 780 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cul5Q9D5V5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms