Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc130Q9D516 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms