Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syce1Q9D495 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms