Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trappc6bQ9D289 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6bQ9D289 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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