Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed3Q9D0L1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms