Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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