Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Utp23Q9CX11 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Utp23Q9CX11 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Utp23Q9CX11 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Utp23Q9CX11 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Utp23Q9CX11 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Utp23Q9CX11 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Utp23Q9CX11 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Utp23Q9CX11 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms