Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CWU4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CWU4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms