Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms