Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms