Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms