Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms