Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nudt21Q9CQF3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nudt21Q9CQF3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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