Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
StambpQ9CQ26 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms