Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Chmp3Q9CQ10 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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