Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg3Q9CPX6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms