Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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