Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NsmfQ99NF2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms