Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl1Q99N96 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl1Q99N96 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms