Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms