Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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