Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms