Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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