Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt84Q99M73 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms