Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Sh3bp5lQ99LH9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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