Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Klhl22Q99JN2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms