Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms