Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx15Q91WE1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms